José Desiderio Rodríguez Lima nació en Salaya, un poblado del municipio Sabana Iglesia, en Santiago República Dominicana, el 30 de septiembre de 1972, hijo de doña Nurys Mercedes Lima y Francisco Rodríguez (La Charca). Lima tiene 5 hermanos, más uno de crianza, entre ellos se destaca Frank Lima el cual es músico. Lima fue firmado a los 17 años por el scout Ramón Peña para los Tigres de Detroit
Lima debutó en las Grandes Ligas con los Tigres de Detroit el 20 de abril de 1994 a los 21 años lanzando contra los Reales de Kansas City. Después de tres años en Detroit, fue cambiado a los Astros de Houston el 10 de diciembre de 1996. En 1999 hizo un récord de 21-10 y fue integrado en el Juego de Estrellas de la Liga Nacional de ese año.
Sin embargo, después de la temporada de 1999, Lima se esforzó para recuperar su éxito, después en esa misma temporada, Lima perdió 16 partidos y toleró 48 jonrones, apenas dos menos que el récord de Bert Blyleven. El 23 de junio de 2001 Lima fue adquirido por Detroit nuevamente a cambio de Dave Mlicki. Fue liberado por Detroit durante la temporada de 2002.
En 2002 lanzó en la Liga Independiente, pero regresó a Grandes Ligas en 2003, cuando fue adquirido por los Reales de Kansas City. En esa temporada, terminó con un record de 7-0 con una efectividad de 2,17,. En 2004 fue adquirido por los Dodgers de Los Angeles. Con los Dodgers, Lima terminó con un record de 13-5 con una efectividad de 4,07, su mejor actuación desde la temporada de 1999. Posiblemente el mejor momento de su carrera fue el 9 de octubre de 2004 en el tercer partido en la Serie Divisional de la Liga Nacional, cuando hizó una blanqueada contra los Cardenales de San Luis.En 2005, regresó a Kansas City como agente libre, pero sólo logró un récord de 5-16, con una efectividad de 6,99. El 14 de febrero de 2006, Lima fue firmado con un contrato de ligas menores por los Mets y lanzó para el equipo AAA Norfolk Tides. Fue integrado en el equipo oficial de los Mets el 7 de mayo de 2006, y tuvo un record de 0-3 con una efectividad de 8.79 en tres aperturas antes de ser designado para asignación el 20 de mayo de 2006.
El 4 de julio de 2006, fue llamado de nuevo a los Mets, cuando Heath Bell fue enviado de nuevo a Norfolk Tides.2 Lima tuvo otra mala salida el 7 de julio de 2006 contra los Marlins de la Florida, que incluye entrega de un grand slam para oponerse pitcher Dontrelle Willis y fue retirado del juego. Después del partido de Lima fue designado para asignación de nuevo al Norfolk Tides por segunda vez durante la temporada 2006. Lima terminó la temporada 2006 con un récord de 0-4 con una efectividad de 9.87 en cuatro aperturas totales para los Mets.
Lanzó por 13 años en Grandes Ligas con los equipos Tigres de Detroit, Astros de Houston, Reales de Kansas City, Dodger de los Ángeles y Los Mets de Nueva York.
De por vida tuvo récord de 89-102 y tuvo una efectividad de 5.27. Su mejor temporada en Grandes Ligas fue en 1999 cuando tuvo marca de 21 -10 con los Astros y efectividad de 3.58, hizo su única aparición en el Juego de Estrellas y finalizó cuarto en la votación para llevarse el trofeo Cy Young. Fue firmado por Ramón Peña para los Astros de Houston,En la pelota dominicana José Lima lanzó por 15 temporadas con las Águilas Cibaeña y Leones del Escogido, siendo uno de los pilares en la corona ganada por las Águilas desde el 2000 al 2009.
Lima, fue uno de los más extrovertidos y carismáticos de los jugadores de Grandes Ligas. Era un espectáculo en el montículo, y es uno de los pocos dominicanos que ha ganado 20 juegos en grandes ligas.
Lima estuvo dos pareja oficiales, la primera se llamó Melissa con quien tuvo un hijo llamado José Lima, Jr, la pareja se separó a principio del 2000. Después tuvo una segunda llamada Dorca Astacio con la cual vivió hasta su muerte. Tuvo 5 hijos en total. Lima mantuvo una relación amorosa con Yohanna Morel, una estudiante de comunicación de Santiago.
A Lima le gustaba cantar y creó un grupo musical llamado El mambo de Lima, del cual era vocalista y director. Lima se preparaba para en su retiro del béisbol llegar a ser comentarista deportivo. Además, estaba preparando una escuela de béisbol en Jinamagao, un pueblo en Valverde donde ya tenía un campo para entrenar jóvenes de la localidad.
Lima ya tenía un historial de problemas cardiacos, pero no fue hasta la mañana del 23 de mayo de 2010 cuando murió a los 37 años de un ataque masivo al corazón. Fue llevado al Huntington Memorial Hospital, donde fue declarado muerto.
